PyMOL

von DeLano Scientific LLC

PyMOL ist eine optisch ansprechende, benutzerfreundliche Software zur Visualisierung und Analyse von Molekülstrukturen.

Betriebssystem: Windows

Publisher: DeLano Scientific LLC

Antivirus-Check: bestanden

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PyMOL

PyMOL ist eine quelloffene und kostenlose Open-Source-Software für Molekularbiologie und Chemie, die es Benutzern ermöglicht, komplexe 3D-Molekülstrukturen und chemische Strukturen zu visualisieren, zu erforschen und zu manipulieren. PyMOL wurde ursprünglich als Software zur Visualisierung und Bearbeitung komplexer molekularer Strukturen entwickelt, ist aber heute vielseitiger und kann auch zur Visualisierung und Analyse von Biomolekülen, zur Vorhersage von chemischen Eigenschaften und zur Entwicklung neuer Molekülstrukturen verwendet werden.

PyMOL ist ein kompaktes Programm, das eine intuitive und benutzerfreundliche 3D-Oberfläche und mehrere Funktionen für die molekulare und chemische Modellierung bietet. Es kann auf einem Computer oder auf einer Vielzahl von Betriebssystemen wie Windows, Mac OS X, Linux, Solaris und AIX ausgeführt werden. PyMOL bietet verschiedene Funktionen, die es Benutzern ermöglichen, komplexe Molekülstrukturen zu visualisieren, zu analysieren, zu erforschen und zu manipulieren.


Funktionen:

• Unterstützung für eine Vielzahl von Dateiformaten, einschließlich PDB, MOL2, XYZ, CIF, OBMol, etc.
• Unterstützung für die Visualisierung von Molekülstrukturen, einschließlich Atomtypen, Bindungsstärken, Ladungen, etc.
• Unterstützung für die Berechnung und Visualisierung von Elektronen-Dichtekarten und Vorhersagen von chemischen Eigenschaften.
• Unterstützung für die Visualisierung von Protein- und Nukleinsäure-Strukturen, einschließlich Ionenbindungen, Hydrogenbrücken, etc.
• Unterstützung für die Visualisierung und Analyse von Biomolekülen, einschließlich Proteinen, Nukleinsäuren, Peptiden, etc.
• Unterstützung für die Erstellung, Bearbeitung und Visualisierung von Protein-Ligand-Komplexen.
• Unterstützung für die Visualisierung und Analyse von Quantenchemie-Ergebnissen, einschließlich Energie- und Orbital-Visualisierungen.
• Unterstützung für die Erstellung und Optimierung von Molekülstrukturen.
• Unterstützung für die Erstellung von Bildern und Animationen.
• Unterstützung für die Erstellung von 3D-Strukturmodellen.
• Unterstützung für die Erstellung von Berichten und Präsentationen.
• Unterstützung für die Erstellung von Scripts und Programmen.
• Unterstützung für die Anwendung von mathematischen Funktionen auf Molekülstrukturen.
• Unterstützung für die Verwendung von PyMOL als Plugin für andere Anwendungen.
• Unterstützung für die Verwendung von PyMOL zur Erstellung von 3D-Druckmodellen.
• Unterstützung für die Verwendung von PyMOL als Programmierschnittstelle (API).
• Unterstützung für die Verwendung von PyMOL als interaktives Werkzeug zur Visualisierung von Molekülstrukturen.
• Unterstützung für die Verwendung von PyMOL als Web-basiertes Werkzeug zur Visualisierung von Molekülstrukturen.
PyMOL ermöglicht es Benutzern, komplexe molekulare Strukturen auf einfache Weise zu visualisieren und zu analysieren.
1. Kompatibilität: Die PyMOL-Software sollte auf den meisten gängigen Betriebssystemen wie Windows, macOS und Linux lauffähig sein.

2. Benutzerfreundlichkeit: Die Software sollte intuitiv bedienbar sein und ein anpassbares Benutzerinterface haben.

3. Kompatibilität mit Datenbanken: PyMOL sollte kompatibel mit allen gängigen Datenbanken sein, wie z.B. PDB, CIF, PQR und MOL2.

4. 3D-Grafiken und Animationen: Die Software sollte 3D-Grafiken und Animationen erzeugen können, um die Struktur und Funktion von Molekülen zu visualisieren.

5. Erweiterbarkeit: PyMOL sollte eine benutzerfreundliche Programmierschnittstelle (API) haben, damit Benutzer ihre eigenen Funktionen hinzufügen können.

PROS
Ermöglicht detaillierte 3D-Darstellungen von komplexen Molekülstrukturen.
Bietet umfangreiche Analyse- und Manipulationsfunktionen für Moleküle.
Unterstützt zahlreiche Dateiformate aus biochemischen Datenbanken.

CONS
Kann komplexe Funktionen für Anfänger verwirrend sein.
Die professionelle Version ist teuer.
Bietet begrenzten Kundensupport.
image/svg+xmlBotttsPablo Stanleyhttps://bottts.com/Florian Körner Andrew K.
Die Software ist ein leistungsstarkes Werkzeug für die Visualisierung, Analyse und Manipulation von Molekülen in 3D. Sie ermöglicht es Benutzern, Proteinstrukturen, Liganden und andere Moleküle in einem interaktiven 3D-Modell zu betrachten und zu bearbeiten. Mit dieser Software können Benutzer auch komplexe Abläufe wie Moleküldynamiksimulationen durchführen und Ergebnisse in verschiedenen Formaten exportieren. Eine weitere wichtige Funktion ist die Möglichkeit, Molekülstrukturen mit Benutzern auf der ganzen Welt zu teilen und zu visualisieren.
image/svg+xmlBotttsPablo Stanleyhttps://bottts.com/Florian Körner James S*******j
"PyMOL ist eine unglaublich leistungsstarke und vielseitige Software zur Visualisierung von Molekülen."
image/svg+xmlBotttsPablo Stanleyhttps://bottts.com/Florian Körner Callum
PyMOL ist eine benutzerfreundliche, interaktive Software für molekulare Visualisierung. Sie ist besonders bekannt für ihre Fähigkeit, qualitativ hochwertige 3D-Bilder von kleinen bis mittelgroßen biologischen Molekülen zu erzeugen. PyMOL ermöglicht den Nutzern, Molekülstrukturen zu betrachten, zu analysieren und sogar zu verändern, was es zu einem unverzichtbaren Tool für Wissenschaftler in der Biochemie und Molekularbiologie macht. Mit einer breiten Palette von Funktionen eignet sie sich besonders für die Darstellung komplexer chemischer Strukturen und biochemischer Interaktionen.
image/svg+xmlBotttsPablo Stanleyhttps://bottts.com/Florian Körner Murray
Benutzerfreundlich, nützlich für Molekülvisualisierung.
Kian
Für alle, die mit 3D-Molekülstrukturen arbeiten müssen, ist dieses Produkt ein wahrer Juwel 💎. Es ermöglicht Ihnen, Strukturen auf vielfältige Weise zu manipulieren - denken Sie an Drehen, Zoomen, Schwenken, und vieles mehr. Sie können sogar das Erscheinungsbild mit Farben und Texturen nach Ihren Wünschen anpassen. Wenn Sie Animationen benötigen, ist dieses Tool ideal und unterstützt Dateiformate wie AVI, MPEG und Flash. Darüber hinaus gibt es eine Vielzahl von Analysetools zur Verfügung, wie die Visualisierung von elektrostatischen Potentialen, Oberflächenanalyse und Abstandsmessungen. All dies und mehr machen es zu einem richtig coolen Stück Software sowohl für Profis als auch für Anfänger.
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