PyMOL
PyMOL ist eine quelloffene und kostenlose Open-Source-Software für Molekularbiologie und Chemie, die es Benutzern ermöglicht, komplexe 3D-Molekülstrukturen und chemische Strukturen zu visualisieren, zu erforschen und zu manipulieren. PyMOL wurde ursprünglich als Software zur Visualisierung und Bearbeitung komplexer molekularer Strukturen entwickelt, ist aber heute vielseitiger und kann auch zur Visualisierung und Analyse von Biomolekülen, zur Vorhersage von chemischen Eigenschaften und zur Entwicklung neuer Molekülstrukturen verwendet werden.
PyMOL ist ein kompaktes Programm, das eine intuitive und benutzerfreundliche 3D-Oberfläche und mehrere Funktionen für die molekulare und chemische Modellierung bietet. Es kann auf einem Computer oder auf einer Vielzahl von Betriebssystemen wie Windows, Mac OS X, Linux, Solaris und AIX ausgeführt werden. PyMOL bietet verschiedene Funktionen, die es Benutzern ermöglichen, komplexe Molekülstrukturen zu visualisieren, zu analysieren, zu erforschen und zu manipulieren.
Funktionen:
• Unterstützung für eine Vielzahl von Dateiformaten, einschließlich PDB, MOL2, XYZ, CIF, OBMol, etc.
• Unterstützung für die Visualisierung von Molekülstrukturen, einschließlich Atomtypen, Bindungsstärken, Ladungen, etc.
• Unterstützung für die Berechnung und Visualisierung von Elektronen-Dichtekarten und Vorhersagen von chemischen Eigenschaften.
• Unterstützung für die Visualisierung von Protein- und Nukleinsäure-Strukturen, einschließlich Ionenbindungen, Hydrogenbrücken, etc.
• Unterstützung für die Visualisierung und Analyse von Biomolekülen, einschließlich Proteinen, Nukleinsäuren, Peptiden, etc.
• Unterstützung für die Erstellung, Bearbeitung und Visualisierung von Protein-Ligand-Komplexen.
• Unterstützung für die Visualisierung und Analyse von Quantenchemie-Ergebnissen, einschließlich Energie- und Orbital-Visualisierungen.
• Unterstützung für die Erstellung und Optimierung von Molekülstrukturen.
• Unterstützung für die Erstellung von Bildern und Animationen.
• Unterstützung für die Erstellung von 3D-Strukturmodellen.
• Unterstützung für die Erstellung von Berichten und Präsentationen.
• Unterstützung für die Erstellung von Scripts und Programmen.
• Unterstützung für die Anwendung von mathematischen Funktionen auf Molekülstrukturen.
• Unterstützung für die Verwendung von PyMOL als Plugin für andere Anwendungen.
• Unterstützung für die Verwendung von PyMOL zur Erstellung von 3D-Druckmodellen.
• Unterstützung für die Verwendung von PyMOL als Programmierschnittstelle (API).
• Unterstützung für die Verwendung von PyMOL als interaktives Werkzeug zur Visualisierung von Molekülstrukturen.
• Unterstützung für die Verwendung von PyMOL als Web-basiertes Werkzeug zur Visualisierung von Molekülstrukturen.
PyMOL ermöglicht es Benutzern, komplexe molekulare Strukturen auf einfache Weise zu visualisieren und zu analysieren.