ImageJ est un logiciel gratuit de traitement et d'analyse d'images largement utilisé dans la communauté scientifique. Ses fonctionnalités les plus importantes incluent la possibilité d'importer et d'exporter une large gamme de formats d'images, des outils d'amélioration et de restauration d'images, des outils de mesure et d'analyse, ainsi que la possibilité de créer des macros et des plugins pour des analyses personnalisées. ImageJ dispose également d'une interface conviviale et est compatible avec plusieurs systèmes d'exploitation.