BioEdit

BioEdit est fondamentalement un éditeur de texte compliqué et puissant. Il s'agit d'un outil destiné aux biologistes moléculaires et aux techniciens de laboratoire qui doivent travailler avec un gène biologique ou des séquences d'ADN, et dont les fonctionnalités sont spécifiquement conçues pour ces utilisateurs. Il rendra votre travail plus efficace en automatisant les tâches courantes et en facilitant l'utilisation des données. Il est capable de relier votre travail à diverses fonctionnalités du National Center for Biotechnology Information (NCBI) pour faciliter l'analyse, et peut également se connecter à d'autres boîtes à outils d'analyse courantes. Dans l'ensemble, cela en fait l'un des outils les plus populaires pour les biologistes moléculaires.

L'interface du programme est très simple.

L'interface du programme est compliquée et il faudra un certain temps aux débutants pour se sentir à l'aise, comme c'est le cas pour tout outil d'analyse plus puissant. En outre, le paquet de documentation est bon, ce qui aidera à l'apprentissage. L'objectif principal sera d'améliorer le processus d'édition et d'alignement des séquences. Le programme permet aux utilisateurs de s'interfacer avec le glisser-déposer à l'aide de la souris ainsi qu'à travers les menus déroulants des fonctionnalités avec des options d'analyse supplémentaires et la possibilité de marquer et d'appliquer différentes couleurs de fond aux séquences pour rester organisé.

La licence freeware et la facilité d'utilisation en font l'un des outils les plus populaires pour les biologistes moléculaires.

Ce programme n'est plus maintenu par le développeur, cependant, il reste une communauté en ligne qui utilise l'outil. Donc, bien qu'il n'y ait pas de support technique officiel, vous pouvez toujours trouver de l'aide en ligne et le paquet de documentation de base est déjà assez robuste comme mentionné.

Caractéristiques:

• Multiples modes pour le dessin de plasmides
.
• Alignement ClustalW intégré
• Recherche Blast intégrée
• Peut se connecter à la banque de fonctionnalités NCBI sur la page web du gouvernement du Centre national d'information sur les biotechnologies à l'adresse ncbi.nlm.nih.gov (qui fait partie de la Bibliothèque nationale de médecine au sein des Instituts nationaux de la santé)
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• Peut également être utilisé avec BioLign
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• Aussi intégré avec la GenBank du NCBI pour une annotation facile
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• Importe les données dans plusieurs formats, notamment ASN, MSF et ALN
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Outil plus ancien et robuste, freeware, efficace. Si vous travaillez dans ce domaine, vous l'utilisez probablement déjà.